A felső légúti fertőzések gyakrabban vírusos felső légúti fertőzések, míg ritkább esetben bakteriális eredetű felső légúti fertőzések. A náthát pl. minden esetben vírusok okozzák, míg a torokgyulladás lehet vírusos és bakteriális eredetű is.
Sőt, előfordulhat az is, hogy a vírusos felső légúti fertőzés, felülfertőződik és baktériumos fertőzés alakul ki. A két típusú fertőzés kezelése alapvetően megegyezik, azonban a bakteriális eredetű felső légúti fertőzések kezeléséhez, súlyosabb esetben, antibiotikumra is szükség lehet.