A bélflóra egészsége nemcsak a bélben dől el. A felszívódás – vagyis az a folyamat, amikor a tápanyagok valóban hasznosulnak – a gyomor állapotán is múlik. Ha a gyomorsav szintje nem megfelelő, az emésztés már az első szakaszban akadályozottá válik. Ez nemcsak puffadáshoz, hanem vitamin- és ásványianyag-hiányhoz, később pedig akár székrekedéshez is vezethet.